[pyfr] 01/04: Merge tag 'v1.4.0' into debian/master

[Ghislain Vaillant]

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ghisvail-guest pushed a commit to branch debian/master
in repository pyfr.

commit 9d1baf15659b0cf56027a144b0b537fcf004ab31
Merge: b4e59fb 96897c3
Author: Ghislain Antony Vaillant <ghisvail at gmail.com>
Date:   Thu Apr 21 08:09:13 2016 +0100

    Merge tag 'v1.4.0' into debian/master

 LICENSE                                            |   2 +-
 doc/src/conf.py                                    |   6 +-
 doc/src/developer_guide.rst                        |  33 +-
 doc/src/home.rst                                   |   5 +-
 doc/src/user_guide.rst                             |  65 ++-
 pyfr/_version.py                                   |   2 +-
 pyfr/backends/__init__.py                          |   1 +
 pyfr/backends/base/backend.py                      |   1 -
 pyfr/backends/cuda/cublas.py                       |   9 +-
 pyfr/backends/mic/__init__.py                      |   3 +
 pyfr/backends/mic/base.py                          |  78 ++++
 pyfr/backends/mic/blasext.py                       |  77 ++++
 pyfr/backends/mic/cblas.py                         |  44 +++
 pyfr/backends/mic/compiler.py                      |  54 +++
 pyfr/backends/mic/generator.py                     | 217 ++++++++++
 .../mic/kernels/__init__.py}                       |   2 -
 pyfr/backends/mic/kernels/axnpby.mako              |  37 ++
 pyfr/backends/mic/kernels/base.mako                |  20 +
 pyfr/backends/mic/kernels/errest.mako              |  20 +
 pyfr/backends/mic/kernels/gemm.mako                |  14 +
 pyfr/backends/mic/kernels/loop-sched.mako          |  69 ++++
 pyfr/backends/mic/kernels/pack.mako                |  32 ++
 pyfr/backends/mic/packing.py                       |  45 +++
 pyfr/backends/mic/provider.py                      |  29 ++
 pyfr/backends/mic/types.py                         | 141 +++++++
 pyfr/ctypesutil.py                                 |   2 +-
 pyfr/integrators/controllers.py                    |  12 +-
 pyfr/plugins/base.py                               |   3 +
 pyfr/plugins/dtstats.py                            |   6 +-
 pyfr/plugins/fluidforce.py                         |  10 +-
 pyfr/plugins/sampler.py                            |  63 ++-
 pyfr/plugins/tavg.py                               |   2 +-
 pyfr/plugins/writer.py                             |   2 +-
 pyfr/quadrules/tet/alpha-opt-n10-su.txt            |  10 +
 pyfr/quadrules/tet/alpha-opt-n120-su.txt           | 120 ++++++
 pyfr/quadrules/tet/alpha-opt-n165-su.txt           | 165 ++++++++
 pyfr/quadrules/tet/alpha-opt-n20-su.txt            |  20 +
 pyfr/quadrules/tet/alpha-opt-n220-su.txt           | 220 +++++++++++
 pyfr/quadrules/tet/alpha-opt-n35-su.txt            |  35 ++
 pyfr/quadrules/tet/alpha-opt-n4-su.txt             |   4 +
 pyfr/quadrules/tet/alpha-opt-n56-su.txt            |  56 +++
 pyfr/quadrules/tet/alpha-opt-n84-su.txt            |  84 ++++
 pyfr/readers/__init__.py                           |   3 +-
 pyfr/readers/base.py                               | 223 ++++++++++-
 pyfr/readers/cgns.py                               | 435 +++++++++++++++++++++
 pyfr/readers/gmsh.py                               | 204 +---------
 pyfr/readers/native.py                             |   1 -
 pyfr/readers/nodemaps.py                           |  69 ++++
 pyfr/shapes.py                                     |  18 +-
 pyfr/solvers/base/inters.py                        |   6 -
 pyfr/solvers/baseadvec/inters.py                   |  12 +-
 pyfr/solvers/euler/inters.py                       |   4 +-
 pyfr/solvers/navstokes/elements.py                 |   4 +-
 pyfr/solvers/navstokes/inters.py                   |  10 +-
 pyfr/solvers/navstokes/kernels/intconu.mako        |   2 +-
 pyfr/solvers/navstokes/kernels/mpicflux.mako       |   2 +-
 pyfr/writers/base.py                               |   2 -
 pyfr/writers/native.py                             |   2 -
 setup.py                                           |   4 +
 59 files changed, 2536 insertions(+), 285 deletions(-)

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